#include "aln_matrices.h"
Variables | |
blosum_dna_matrix_t | dna_full |
blosum_iupac_matrix_t | iupac_full |
Initial value:
{ {5,-4,-4,-4, -2}, {-4,5,-4,-4, -2}, {-4,-4,5,-4, -2}, {-4,-4,-4,5, -2}, {-2,-2,-2,-2,-1}}
Initial value:
{ {5,-4,-4,-4,-4,1,1,-4,-4,1,-4,-1,-1,-1,-2,-4}, {-4,5,-4,-4,-4,1,-4,1,1,-4,-1,-4,-1,-1,-2,5}, {-4,-4,5,-4,1,-4,1,-4,1,-4,-1,-1,-4,-1,-2,-4}, {-4,-4,-4,5,1,-4,-4,1,-4,1,-1,-1,-1,-4,-2,-4}, {-4,-4,1,1,-1,-4,-2,-2,-2,-2,-1,-1,-3,-3,-1,-4}, {1,1,-4,-4,-4,-1,-2,-2,-2,-2,-3,-3,-1,-1,-1,1}, {1,-4,1,-4,-2,-2,-1,-4,-2,-2,-3,-1,-3,-1,-1,-4}, {-4,1,-4,1,-2,-2,-4,-1,-2,-2,-1,-3,-1,-3,-1,1}, {-4,1,1,-4,-2,-2,-2,-2,-1,-4,-1,-3,-3,-1,-1,1}, {1,-4,-4,1,-2,-2,-2,-2,-4,-1,-3,-1,-1,-3,-1,-4}, {-4,-1,-1,-1,-1,-3,-3,-1,-1,-3,-1,-2,-2,-2,-1,-1}, {-1,-4,-1,-1,-1,-3,-1,-3,-3,-1,-2,-1,-2,-2,-1,-4}, {-1,-1,-4,-1,-3,-1,-3,-1,-3,-1,-2,-2,-1,-2,-1,-1}, {-1,-1,-1,-4,-3,-1,-1,-3,-1,-3,-2,-2,-2,-1,-1,-1}, {-2,-2,-2,-2,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-2}, {-4,5,-4,-4,-4,1,-4,1,1,-4,-1,-4,-1,-1,-2,5}}
Referenced by aln(), and small_in_large().